Позитивные стороны были. Например, именно инквизиция стала пионером в введении современной следственно-судебной процедуры, со сбором доказательств в целях выявления вины или невиновности обвиняемого. Ну и еретики с которыми она боролась были далеко не ангелами, а скорее уж тогдашним аналогом нынешних политических радикалов. В общем, если рассматривать деятельность инквизиции в свете той вакханалии, которая началась с Реформацией, то становиться понятнее, против чего они боролись.