Боевые маневрирующие корабли намного более сложная цель чем транспорт.
С ними немецкая авиация боролась скорее методом повреждения близкими разрывами и отправкой в ремонт, чем методом утопления.
С транспортами немцам бороться было проще, понятное дело.