Удар по нескольким грамотно выбранным электроподстанциям или электростанциям так, чтобы крупномасштабный блэкаут вызвать - и приехали. Сомневаюсь, что в условиях процветающего капитализма японская энергосистема надежным резервированием похвастаться может.
Можно еще по объектам городской канализации вдарить. Тоже вполне доходчиво.А еще можно попытаться мосты между островами разрушить, хотя это наверно вряд-ли возможно неядерным оружием.
Ну и наконец морские нефтяные терминали упомянули: всю нефть Япония через них получают. Если сгорят сами терминалы и стратегические запасы нефти в хранилищах возле них, то Япония окажется на коленях