Вообще в те времена была такая практика: если на кого-то имелась компрометирующая информация, то человека от греха подальше удаляли с прежнего ответственного поста на менее ответственный. Как например Ежова, да и многих других. Помнится, Веревкин-Рахальский писал о таком явлении применительно к академии Фрунзе, которая превратилась в "пункт сбора поврежденной техники", по чёрному юмору того времени - из-за обилия попавших под подозрение командиров, переведенных туда из войск.
Похоже, ПВО считалось таким - менее важным местом, чем предыдущий пост Штерна (напомню - во время перевода в ПВО у нас ещё не было договора о нейтралитете с Японией).
То есть раскручивалось дело о каком-то заговоре, которое пришло к завершению позднее, и служба Штерна в ПВО тут была ни при чём.