После распада СССР, продолжил службу в Вооружённых Силах Российской Федерации на различных должностях. В 2002 году полковник Черножуков А.В. окончил Военную академию Генерального штаба Вооруженных Сил РФ, и был назначен на должность начальника отдела по контролю и координации за похоронным обеспечением в Вооруженных Силах РФ. Живёт в городе-герое Москве.