Воду сначала собирают со двора в открытый резервуар, оттуда через песчаный фильтр она спускается в соседний закрытый резервуар немного ниже уровнем. Затем можно отфильтровать еще раз перед спуском уже в глубокий подземный резервуар.
Наверное, качество будет неидеальное - но терпимое, по средневековым понятиям. Для простонародья и скотины сойдет.
Российские неглубокие деревенские колодцы пополняются сходным образом из поверхностных вод, и ничего, живут как-то.