делается вариант для другого применения с высокой степенью совместимости. Этот вариант получается не совсем совместимым :-), зато более развитым, поэтому впоследствии исходную версию дорабатывают по образцу этой ветки, получая и апгрейд, и лучшую совместимость.
Встречал не единожды, да и сам такие ветки плодил. Не в ракетостроении, правда.