>Но разве тогда рота называется отдельной? Рота в полку - это подразделение, а они отдельными, как я понимаю, не бывают.
Отдельная рота - это не рота в полку.
Это рота, подчиняющаяся непосредственно командующему дивизией, корпусом, либо армией.
Например, разведрота дивизии, рота связи корпуса, и т.д.